More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0106 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  82.96 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  67.26 
 
 		 229 aa  300  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  63.88 
 
 		 232 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  33.85 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  33.64 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  30.56 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  26.67 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.95 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25.47 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25.47 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25.47 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.47 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2686  regulatory protein TetR  30.15 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  30.35 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  26.2 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1185  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  27.64 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  29.02 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 324 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>