More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3475 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  97.46 
 
 
197 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  50.81 
 
 
203 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
218 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
214 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
207 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
222 aa  134  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
216 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 
206 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
211 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
195 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
195 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
200 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 
186 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
194 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 
207 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  41.98 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
217 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 
189 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
188 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
196 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
189 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 
191 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 
206 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
192 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  43.8 
 
 
201 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 
188 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 
188 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  42.98 
 
 
201 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 
187 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 
179 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
200 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
189 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
208 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
196 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
204 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6699  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 
207 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.678516  normal  0.427356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
204 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
202 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  39.1 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 
183 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  35.54 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
196 aa  89  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
257 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
201 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
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NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
209 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0048122 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
184 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
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