More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0994 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 202 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 246 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  38.17 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  31.86 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  35.5 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  32.06 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 227 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  29.69 
 
 		 241 aa  88.2  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  30.58 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  34.27 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  30.73 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>