More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4578 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 215 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  32.31 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  33.51 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  31.15 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
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NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
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NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
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NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  28.16 
 
 		 213 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  43.16 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
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