More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4440 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  62.63 
 
 		 214 aa  264  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  38.27 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  36.11 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 255 aa  92  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  31.31 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 214 aa  88.6  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  34.46 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  34.16 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  32.93 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  27.8 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  27.96 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
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NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
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NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
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NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
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NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
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