More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1062 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
241 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  36.6 
 
 
221 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  34.03 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
227 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  33.01 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
246 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
224 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
224 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
230 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
247 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
255 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
214 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
222 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 
223 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 
222 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
224 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 
211 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
215 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
240 aa  104  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
215 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
215 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
224 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
224 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
224 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
237 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
227 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  28.92 
 
 
215 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
232 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  31.96 
 
 
218 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
225 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
215 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
248 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
223 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
210 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
210 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
223 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
233 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
220 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  33.51 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
270 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 
225 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
242 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
218 aa  89  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
212 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.59 
 
 
239 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
212 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
239 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
231 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  30.9 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
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NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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