More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0636 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  32.49 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 215 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 225 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  29.55 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  30.28 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 220 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 225 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.68 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  34.1 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  28.06 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  31.76 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
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NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
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NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
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NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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