More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1987 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  34.74 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  37.5 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  37.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  37.5 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  37.5 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  35 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  33.65 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
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NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  25.38 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
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NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
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NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  25.89 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
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NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  25.38 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  25.38 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  35.85 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  24.37 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1423  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0158  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0140  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0147  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
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NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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