More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5318 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  42.99 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  48.81 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.89 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.39 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.83 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 317 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  52.54 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>