More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2192 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  75.94 
 
 		 229 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3421  putative transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  72  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4895  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  42.5 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  40.23 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  49.09 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  49.09 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  43.1 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.76 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.76 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1955  putative transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0176094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  26.67 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  44.07 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  28.4 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  44.12 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 410 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  31.96 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  27.27 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  29.01 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  45.45 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 316 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 316 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 316 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>