More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0225 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  34.43 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  34.43 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  25.98 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  28.05 
 
 		 340 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  26.83 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  24.31 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  24.04 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  23 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  28.91 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  53.23 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 245 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>