More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0805 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 242 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 242 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.46 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  28.21 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
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NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  31.29 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4037  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.766436 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
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NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4749  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.65 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4569  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000147437  normal  0.0336832 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.17 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.17 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.65 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  26.19 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  28.72 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  27.6 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  28.72 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  28.72 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  28.72 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  28.65 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  28.72 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0537  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  25.27 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4062  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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