More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1807 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 239 aa  332  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  33.5 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  31.31 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 372 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.48 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.28 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.28 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.46 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0967  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.16 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0854  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.22 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0946  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.22 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0914  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.22 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00763  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.827218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2846  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0944  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2847  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0304787 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.1 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0882  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.85 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4661  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.384248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  29.35 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  44.3 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  29.35 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  29.63 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  40.48 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  51.85 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  31.62 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  28.18 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  35.14 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>