More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 208 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 244 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  27.67 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.14 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  24 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  32.65 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.25 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.25 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
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NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  37.04 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.94 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
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NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  26.24 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  40.74 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  40.74 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  41.51 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  53.06 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
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NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
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