More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4133 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  98.62 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  88.02 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  88.02 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  88.02 
 
 		 219 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  82.95 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  81.91 
 
 		 204 aa  338  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  33.7 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 246 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2483  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0489732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.71 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.39 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  25.26 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  47.76 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  26.96 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  36 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  26.96 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  24.48 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  28.87 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  26.96 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.96 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  26.96 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  36.99 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  27.32 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  34.15 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>