188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1072 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1683  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 227 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7122  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3610  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6229  transcriptional regulator TetR family  24.56 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25.24 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3570  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3643  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.664525  normal  0.339834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3575  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  26.55 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  21.02 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>