More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5561 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.66 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  41.97 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  34.52 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
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NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  46.67 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
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NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
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