More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5773 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  52.63 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  59.62 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  58.18 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  33.73 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  43.55 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  44.64 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  43.55 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  43.86 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>