More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0253 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  70 
 
 		 193 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  70 
 
 		 193 aa  264  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  42.57 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 228 aa  111  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  33.17 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  32.82 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  40 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.77 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  36.11 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  47.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  47.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  43.75 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  43.75 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  43.75 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>