More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0876 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  43.19 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  39.23 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  35.37 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  33.79 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  61.84 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  32.86 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  37.84 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  43.28 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  36.14 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  30.16 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  29.73 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  25.34 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  38.16 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  22.6 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  38.03 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
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