273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2064 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  62.25 
 
 		 218 aa  287  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  42.79 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  36.84 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 233 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 233 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  40.69 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 226 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.57 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0088  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  27.43 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1189  regulatory protein TetR  27.44 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  28.29 
 
 		 264 aa  48.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  22.06 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  35.21 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>