More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  51.24 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  45.85 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>