More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13324 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 216 aa  288  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  31.66 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 388 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.23 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.42 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 125 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 424 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 374 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 420 aa  53.1  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  39.13 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>