More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0969 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  81.02 
 
 		 216 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1859  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3467  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0688  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0733  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.13 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.97 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  43.48 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.28 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 360 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>