More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3533 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  86.16 
 
 		 257 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  83.63 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 250 aa  258  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  32.13 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  35.43 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  40.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.39 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  34.38 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>