More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3806 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  49 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  33.67 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  33.68 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  52.46 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  46.03 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>