More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4533 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  49.46 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  48.92 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  48.92 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 335 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  25.88 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>