More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0196 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 200 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 196 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 205 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 236 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  22.22 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  21.79 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  22.35 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  25.14 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  29.7 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>