More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3563 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  82.93 
 
 		 248 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  83.9 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  72.38 
 
 		 248 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  69.88 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 248 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 248 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  69.08 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  72.37 
 
 		 248 aa  351  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  73.25 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  70.82 
 
 		 240 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 234 aa  296  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 234 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  21.58 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.52 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 196 aa  62  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
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