More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1381 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  361  4e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 269 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  34.45 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  34.09 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 291 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 228 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  28.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>