More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1936 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 269 aa  68.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 335 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.45 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  57.45 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  48 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>