More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0282 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  40.23 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  22.3 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  24.11 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  21.48 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  26.22 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  18.71 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  28.48 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.74 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>