More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4122 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4173  TetR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.243858  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  36.05 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 446 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  29.91 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  39.73 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  33.33 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 176 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 257 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>