More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  430  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 194 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 196 aa  247  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 200 aa  231  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  58.82 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  60.75 
 
 		 204 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  46.56 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 214 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 188 aa  91.7  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.15 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 260 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
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NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 770 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.56 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
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NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
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NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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