More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6295 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
212 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
228 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
188 aa  105  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 
211 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
238 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
256 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
223 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
217 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
208 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
202 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
206 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
246 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  22.06 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.74 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
418 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
287 aa  68.2  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  24.18 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  26.11 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  25.73 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
770 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
244 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.69 
 
 
190 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1393  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
225 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  28.21 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
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NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
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NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
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NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
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