More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0402 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  97.96 
 
 		 206 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  81.03 
 
 		 201 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  66.15 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 193 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 194 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  47.45 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 232 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 285 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  31.95 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  34.16 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.89 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  28.64 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  25.45 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.43 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>