More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3833 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  63.54 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 200 aa  230  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  57.22 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  61.14 
 
 		 197 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 197 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  46.45 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  42.05 
 
 		 224 aa  148  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27.65 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 434 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 482 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.51 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 482 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.32 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 310 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
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NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
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