More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4073 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 260 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  48.54 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  47 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 770 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 285 aa  85.5  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 418 aa  72  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
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NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
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NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
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