More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2995 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  85 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  74.76 
 
 		 236 aa  330  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  72.43 
 
 		 236 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  75.65 
 
 		 236 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 770 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.96 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 251 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  24.19 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>