More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0516 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  29.26 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.02 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.35 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  24.75 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.19 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  24.05 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 255 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 259 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 251 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>