More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0153 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 770 aa  168  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  42.29 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 424 aa  65.1  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 419 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  26.07 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  27.01 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  27.01 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  29.47 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.07 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  26.07 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.19 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  27.14 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 422 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.55 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>