More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5045 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.07 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.98 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 770 aa  58.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.7 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
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NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32.03 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.53 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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