56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0615 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  90 
 
 		 204 aa  256  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  75.71 
 
 		 204 aa  221  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 202 aa  76.6  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 201 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 209 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.63 
 
 		 211 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  19.7 
 
 		 214 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  20.8 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 210 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 210 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 228 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 223 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 189 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 197 aa  42  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 195 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 234 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>