More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05345 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  100 
 
 		 190 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  25 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  21.58 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  23.33 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  22.78 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  22.22 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  19.67 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 260 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  20.61 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  22.04 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  20.33 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.89 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  21.52 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  20.97 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.08 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  17.22 
 
 		 388 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  20.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  19.58 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>