More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1145 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  99.55 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  99.11 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  95.59 
 
 		 226 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 225 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 225 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  39.49 
 
 		 198 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  38.97 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 222 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 213 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.53 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 770 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.96 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2454  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  62  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  27.14 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>