More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1401 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 202 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  43.01 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  46.2 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 		 242 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 195 aa  161  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  46.24 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  46.24 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 195 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  45.7 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  45.7 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.5 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.49 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.17 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
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