More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1287 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  100 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  43.68 
 
 
211 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 
205 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
198 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 
197 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  33.52 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
195 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
196 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
198 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 
202 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
211 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
201 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
192 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  31.07 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  28.64 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 
186 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
224 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
198 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  27.75 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 
188 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.73 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
221 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
227 aa  58.9  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.44 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.81 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 
187 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  34.67 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  34.67 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  41.27 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
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