More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2925 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  55.96 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 192 aa  137  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 225 aa  130  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 		 234 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  37.17 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  35.18 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  38.55 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  39.53 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.86 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  46.84 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.69 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 453 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
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NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
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NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
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NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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