More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0235 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  55.61 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 197 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  54.92 
 
 		 195 aa  209  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 195 aa  205  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  55.19 
 
 		 196 aa  202  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  55.8 
 
 		 201 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 201 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 198 aa  185  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  44.04 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  24.61 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  29.85 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.93 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  36.52 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  38.04 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  36.99 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  31.43 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
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NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  24.34 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
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NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
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NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
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NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 307 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
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