More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3860 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  76.42 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 208 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  29.44 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.49 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  36.76 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  36.59 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  31.51 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  35.82 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.93 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  35.82 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  35.82 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  35.82 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  35.48 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  41.51 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 190 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>